데이터 이전 후 설명 없는 NullPointerException

 ERROR TaskSetManager: Task 0 in stage 5.0 failed 4 times; aborting job
org.apache.spark.SparkException: Job aborted due to stage failure: Task 0 in stage 5.0 failed 4 times, most recent failure: Lost task 0.3 in stage 5.0  : java.lang.NullPointerException
    at org.apache.spark.sql.execution.datasources.orc.OrcColumnVector.getUTF8String(OrcColumnVector.java:167)
    ...

데이터 이전을 잘 하고 나머지 집계도 잘 동작하는지 확인하기 위해 검증하는 도중 원인 설명이 제대로 되지 않은 문제가 발생했다.

원인

이전 이전의 Table에 필요한 columns을 추가하였고, 생성문은 관련된 columns끼리 묶어 관리하기 위해 순서를 변경함

그로 인하여 기존 테이블 스키마 순서와 이전할 테이블의 순서가 다르기 때문에 문제가 발생함.

간단 설명

  1. 아래와 같은 테이블이 존재했다 가정하고 시작해보자

    id passwd name
    id1 passwd1 nane1
    id2 passwd2 nane2
    id3 passwd3 nane3
  2. email칼럼을 추가하기위해 데이터를 추가하였다.

    id passwd name email
    id1 passwd1 nane1 email1
    id2 passwd2 nane2 email2
    id3 passwd3 nane3 email3
  3. 이전한 테이블은 id,passwd,email,name 순으로 테이블 스키마를 정의했다.

  4. create external table if not exists db명.tb명 ( id string , passwd string , email string , name string ) ;

  5. 복제할때 기존 테이블의 스키마 순서인 id,passwd,name,email 가아닌 id,passwd,email,name 로 스키마 순서가 바뀌어 데어터 순서가 뒤섞여 복제가 되었다.

    id passwd email name
    id1 passwd1 nane1 email1
    id2 passwd2 nane2 email2
    id3 passwd3 nane3 email3

해결책

1번 해결책

생성문을 기존 칼럼 순서와 동일하게 만든다.

create external table if not exists db명.tb명 (
      id      string
    , passwd  string
    , name    string
    , email   string
)
;
  • 위에 설명한 원인을 예시로 보면 위와 같이 기존 테이블 순서에 맞게 변경한 후 이관시킨다
  • 하지만 이 방법은 columns끼리 묶으려고 순서를 변경하였기에 썩 좋지 않은 방법이라고 생각한다.

2번 해결책 ( 실패 )

ALTER TABLE test_change CHANGE [ col_name ] [col_new_name] [type] [location] 을 이용하여 순서변경

alter table db명.tb명 change id     id      string first         ;
alter table db명.tb명 change passwd passwd  string after  id     ;
alter table db명.tb명 change name   name    string after  passwd ;
alter table db명.tb명 change email  email   string after  name   ;
  • 실 구동은 해보지 않음 hive cwiki

  • 아래 테이블의 차이처럼 metadata 까지 변경 되는것으로 보이기 때문에 기각

    id passwd email name
    id1 passwd1 nane1 email1
    id2 passwd2 nane2 email2
    id3 passwd3 nane3 email3
    id passwd name email
    id1 passwd1 email1 nane1
    id2 passwd2 email2 nane2
    id3 passwd3 email3 nane3

3번 해결책 ( 성공 )

select a.CD_ID, a.COLUMN_NAME, a.INTEGER_IDX
from hive.COLUMNS_V2 a
inner join hive.SDS b
    on  b.CD_ID = a.CD_ID
inner join hive.TBLS c
    on  c.SD_ID = b.SD_ID
    and c.TBL_NAME = 'table_name'
order by INTEGER_IDX
;
  • 출력 예시

    CD_ID COLUMN_NAME INTEGER_IDX
    504 member_id 0
    504 char_id 1
    504 first_time 2
    504 last_time 3
    504 reg_time 4
  • 위와 같이 metastore 정보를 확인해보면 COLUMN_NAME,integer_idx을 확인할 수 있다.

  • 해당 COLUMN_NAME과 INTEGER_IDX의 값과 순서를 기존 테이블과 동일하게 만들어주면된다.

  • 따로 외래키등이 걸려있지 않아서 해당 CD_ID의 값을 insert overwrite로 해결하였다.

추정되는 원인

기존에 hive.metastore.schema.verification=false로 처리가 되어 있어 schema 검증을 제대로 안 되서 그런 것으로 추정됨

hive --orcfiledump /File_Path 이 명령어를 이용하여 orc 파일의 schema를 확인해보니, 아래와 같다.

  1. hive.metastore.schema.verification=true

    Structure for /File_Path
    File Version: 0.12 with HIVE_8732
    Rows: 1151
    Compression: SNAPPY
    Compression size: 262144
    Type: struct<member_id:string,char_id:string,first_time:timestamp,last_time:timestamp,reg_time:timestamp>
    
    Stripe Statistics:
    Stripe 1:
        ...
    
    File Statistics:
    ...
    
    Stripes:
    ...
  2. hive.metastore.schema.verification=false

    Structure for /File_Path
    File Version: 0.12 with HIVE_13083
    Rows: 1095
    Compression: SNAPPY
    Compression size: 262144
    Type: struct<_col0:string,_col1:string,_col2:timestamp,_col3:timestamp,_col6:timestamp>
    
    Stripe Statistics:
    Stripe 1:
        ...
    
    File Statistics:
    ...
    
    Stripes:
    ...

위 결과를 보면 hive.metastore.schema.verification=true를 해야 orc의 schema값이 Hive의 스키마로 잘 생성된다.

  1. true

    • Type: struct<member_id:string,char_id:string,first_time:timestamp,last_time:timestamp,reg_time:timestamp>
  2. false

    • Type: struct<_col0:string,_col1:string,_col2:timestamp,_col3:timestamp,_col6:timestamp>

데이터 이전 전의 테이블이 false로 되어있던 것 이기 때문에 테스트는 하지 못 하였으나, 겪은 문제처럼 칼럼 순서가 뒤바뀐 이유는 이것으로 추정된다.

spark 2.4.8, scala 2.11

에러 문구

org.apache.spark.sql.AnalysisException: Table or view not found: `dbName`.`tbName`; line 12 pos 9;

Intellij 에서 실행시킬 때 아주 잘 작동하였으나, 테스트 서버에 배포하여 spark-submit하니 위와 같이 해당 테이블을 찾지 못하는 문제가 발생하였다.

개인적으로 확인한 리스트

  1. MetaStore URL 설정여부
    val sparkConf: SparkConf = new SparkConf()
        .set("hive.metastore.uris", AppConfig.hiveMetastoreUrl)
- 위와 같이 `"hive.metastore.uris"`  에 metastore url을 잘 작성해주었나?
    - 당연히 intellij에서 실행이 잘 되는건 잘 넣어줬기 때문이다.
  1. enableHiveSupport() 설정 여부
    SparkSession.builder().config(SparkConfig.sparkConf)
                          .enableHiveSupport()
                          .getOrCreate()
  • 위와 같이 enableHiveSupport()를 잘 넣어 주었나?
    • 당연히 intellij에서 실행이 잘 되는건 잘 넣어줬기 때문이다.
  1. HDFS 권한 문제?
    hdfs dfs -ls /HiveTablePath
  • 따로 설정하지 않았지만, 확인 결과 문제는 없었다.
  1. Hive-site.xml을 제대로 읽지 못 했다?
    spark-submit \
    --class Execute class path \
    --master Mode \
    --jars "Extra library Path/*.jar" \
    --files Hive Site Path/hive-site.xml \
  • 빙고 Spark submit이 hive-site.xml을 읽어오지 않아 발생한 문제였다
    • metastore설정이 잘 되어 있는데 왜 잘 작동하지 못 하는지는 추후 확인 해 봐야겠다.

개인적인 팁

  • 한가지 팁으로는 --jars "Extra library Path/*.jar" ( 잘못된잘못된 정보를 공유하는 것일 수 있으니, 틀린 정보면 알려주시면 감사하겠습니다.)
    • 위 *.jar은 Spark 1.6을 사용할 때 사용불가였지만, 2.4로 넘어오니 동작하였다. (spark 1.6 : "~~/lib1.jar,lib2.jar....")
    • Extra library Path에 Prefix를 넣어 원격지의 jar파일을 가져와서 읽을 수 있다. (e.g: hdfs://///*.jar)
      • 필자 경험상 이렇게 안 하고 로컬의 library를 사용하면, 지속적으로 HDFS에 업로드
      • 위와 같이 실행하는 hdfs에 올려놓으면 업로드 하지 않고, 해당 lib에 링크걸어서 사용하는 것으로 보였다.

필자는 4번으로 해결했다. 이것도 아니였으면 더 많은 것을 찾아봐서 더 많은 오류 해결 방법을 습득했을 것 이지만, 그래도 빠르게 해결되서 다행이다.

버전

  • Spark 2.4.8, Scala 2.11.12

Spark 2.4.8, Scala 2.11.12

회사에서 마이그래이션을 위해서 새로 구현한 Spark 배치/스트리밍을 서버에 배포하여 실행 테스트를 해보니 아래와 같은 에러가 발생하였다.

diagnostics: User class threw exception: java.lang.NoSuchMethodError: scala.Product.$init$(Lscala/Product;)V

위 에러는 Scala의 메소드를 실행시킬 수 없다는 에러 문구다
해당 에러가 발생하는 곳을 따라가보니 발생하는 곳을 확인해보니 case class에서 발생하는 에러였다.

case class TableInfo(serviceType: String, databaseName: String, tableName: String)

확인해보니, 서버에 구축된 Spark의 Scala 버전과 Build시 사용하는 Sacla 버전이 달라 문제가 발생한 것이였다.

spark 2.4.8버전이기때문에 당연히 scala 2.12버전으로 구축 했을 줄 알았는데 확인해보니 Scala 2.11.12 버전으로 설치해 놨었다..

spark 버전 확인하는 방법은 다음과 같다

[~]$ spark-sql --version
Welcome to
      ____              __
     / __/__  ___ _____/ /__
    _\ \/ _ \/ _ `/ __/  '_/
   /___/ .__/\_,_/_/ /_/\_\   version 2.4.8.3.1.0.0-2
      /_/

Using Scala version 2.11.12, Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM, 1.8.0_192

[~]$ spark-shell --version
Welcome to
      ____              __
     / __/__  ___ _____/ /__
    _\ \/ _ \/ _ `/ __/  '_/
   /___/ .__/\_,_/_/ /_/\_\   version 2.4.8.3.1.0.0-2
      /_/

Using Scala version 2.11.12, Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM, 1.8.0_192

다음 부터는 공식홈페이지에 아래와 같이 scala 2.12를 사용해야한다고 해서 당연히 그렇게 구축되어 있다고 생각하면 안 되겠다. 개발전에 구축된 버전을 먼저 확인하고 개발을 진행해야겠다.

Spark runs on Java 8, Python 2.7+/3.4+ and R 3.5+. For the Scala API, Spark 2.4.8 uses Scala 2.12. You will need to use a compatible Scala version (2.12.x).

Spark 2.4.8 공식홈페이지

hint: You've added another git repository inside your current repository.
hint: Clones of the outer repository will not contain the contents of
hint: the embedded repository and will not know how to obtain it.
hint: If you meant to add a submodule, use:

위와 같은 에러가 나왔다면, 아래 3단계를 해보면 아마 될 것입니다.

  1. 올리고자 하는 디렉터리에 .git폴더 유무를 판단하고, 있다면 삭제해줍니다.
  2. git rm --cached 머기시를 쳐봅니다.
  3. git rm --cached . -rf를 실행하고 재시도해보면 아마 될 것입니다. ( 저는 성공했습니다. )

위 해결법은 깃안에서 화살표 달려있는 폴더로 표시되서 안으로 못 들어가는 에러도 해결됩니다!

각 단계를 실행하고, commit , push를 시도해 보세요 ㅎ

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